Capaian lulusan Program Studi Magister Bioteknologi secara umum adalah sebagai berikut:
- Memiliki kemampuan berpikir kritis terhadap berbagai permasalahan yang terkait dengan Bioteknologi.
- Memiliki kemampuan umum dalam laboratory skills di bidang rekayasa molekul, sel dan jaringan.
- Menguasai teknik-teknik laboratorium yang berkaitan dengan salah satu bidang Bioteknologi: industri, kesehatan atau agrikultur.
- Mampu bekerja mandiri maupun berkelompok.
- Memiliki etos kerja yang baik dan kemampuan berinovasi yang baik.
- Menguasai konsep-konsep (ilmu pengetahuan) dan teknik-teknik dalam lingkup Bioteknologi.
- Mampu merencanakan, merancang, melaksanakan penelitian berlatar belakang Bioteknologi industri, kesehatan dan agrikultur, serta mempublikasikan hasil penelitian tersebut secara semimandiri.
- Melalui ilmu pengetahuan dan teknik rekayasa, lulusan mampu menciptakan produk-produk berbasis sistem hayati yang punya mempunyai nilai tambah di industri, kesehatan dan agrikultur.
- Memiliki kemampuan berkomunikasi ilmiah secara oral dan tertulis
- Mengikuti perkembangan terkini dalam ilmu Bioteknologi serta menyadari pentingnya pembelajaran sepanjang hayat.
Dengan adanya tiga Jalur Pilihan, maka Capaian Lulusan khusus untuk masing-masing Jalur Pilihan Bioteknologi adalah:
Untuk Jalur Pilihan Bioteknologi Industri
11. Menguasai bidang-bidang interdisiplin yang berkaitan dengan bioteknologi industri dengan memanfaatkan pendekatan selular dan molekular.
Untuk Jalur Pilihan Bioteknologi Kesehatan
12. Mampu mengaplikasi bidang bioteknologi kesehatan khususnya terkait penyakit dan diagnose dengan menggunakan pendekatan selular dan molekular.
Untuk Jalur Pilihan Bioteknologi Agrikultur
13. Mampu memanipulasi dan meningkatkan kualitas tanaman, hewan agrikultur dengan menggunakan pendekatan selular dan molekular.